雪男は燐に決別を告げ、イルミナティへと向かってしまった。　　強さを求め、真実を求める雪男と向き合うためには、　　自分たちの出生の秘密を知る必要があると決意した燐は、　　メフィストの手引きで過去へと

　　1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天

　　在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。　　数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素

　　金田一一（道枝骏佑饰）祖父是名侦探金田一耕助，是一位天才高中生侦探，用超过IQ180的头脑解开了充满难解之谜的杀人事件。平时是个充满热情的高中男生，事件发生后，会与青梅竹马的七濑美雪（上白石萌歌饰

　　松田启人（津村真琴 配音）是一个热爱幻想的五年级男生，一次偶然中，启人捡到了一张神奇的卡片，这张卡片将启人带往了生活着数码兽的数码世界，在那里，启人遇见了基尔兽，此时的他并不知道，基尔兽将会是他一

　　2002年，数码世界面临灭亡的危机！数码世界本是由究极天使兽、基路比兽及神圣天女兽三大天使所管治的，然而其中一位天使——基路比兽却叛变，这使得数码世界的平衡受到破坏，并开始崩溃……　　古代曾经拯救

　　大门大意外地遇到了亚古兽，两人见面就大打出手，亚古兽战败后称大门大　　为大哥，但是数码特搜部队（DATS）不容许未受其队员管理的数码兽留存在这个世界上，必需送回数码世界，而后汤岛告诉大若加入DAT

　　一天，工藤大器偶然听到了神秘声音的呼唤，与朋友们一起来到了数码世界，在那里认识了众多的数码兽同伴并且成为指挥官建立“Xros Heart”团队。意想不到的是，在数码世界中除了他们外竟然还有别的人类

　　紅葉みさき等四名少女是特殊部隊“セラフィム”的候补生，为了成为正式成员而在ウォッチャーズ ネスト闻鸡起舞。但是她们并不知道，真正的敌人异型生命体“グール”有多么可怕……

　　セラフィム指挥官ライアー等人用空间跳跃的方式将宇宙站ウォッチャーズ ネスト的居住区整个转送到了地球圈，却发现地球被一层时间屏障覆盖。为了查明真相，ライアー决定冲进时间屏障，却进入了另一个时间轴……