墨西哥及尤卡坦半岛上，有着闻名世界的玛雅人库库尔坎金字塔。在金字塔中的秘密通道里，有一个可以通往龙之谷大陆的传送门。传说，龙之谷大陆是羽蛇神·库库尔坎居住的大陆，在龙之谷大陆中的，封印着一枚神秘的库库尔坎纹章。库库尔坎纹章上记录了玛雅人关于对天文研究的方法及5个预言的簪文，以及玛雅鼎盛时期的贵族黄金宝藏。拥有库库尔坎纹章的国家，除了能获知玛雅人天文、数学方面的高超算术能力成为统治“天空霸主”之国外，而库库尔坎纹章的使者更可掌握死亡和重生的权能。一次偶然的机会，印第安纳·琼斯（哈里森·福特 饰）获得好友赠送

故事开始于 2006 年的阿姆斯特丹，费瑞·博曼为毒枭拉尔夫·布林克工作。拉尔夫·布林克是一名强大的罪犯，也是费瑞的导师。一天，这伙人遭到残忍的抢劫，拉尔夫的儿子受了重伤。当所有的线索都指向布拉班